肛瘺又稱“肛門直腸瘺”，大部分肛瘺由肛門直腸膿腫破潰或切開排膿后形成。膿腫逐漸縮小，但腸內(nèi)容物仍不斷進入膿腔，在愈合縮小的過程中，常形成迂曲的腔道，引流不暢不易愈合，日久后腔道周圍有許多疤痕組織，形成慢性感染性管道。
(1)小兒骶骨曲尚未形成，肛門內(nèi)括約肌緊張度較弱，糞便易直接壓迫肛管處齒線，肛竇粘膜擦破，易使細菌侵入致病。這個細菌進入以后，因為環(huán)境比較潮濕，容易促使細菌的不斷的繁殖，就會逐漸的發(fā)展，孩子也不會說，時間長了就形成了肛瘺。
(2)小兒常因尿布皮炎，刺激肛門周圍皮膚，形成肛門周圍皮下膿腫與肛竇相通，而成肛瘺。這種情況也是很多的，有些家長比較粗心，孩子發(fā)炎了，也不知道，看見了，也不會計算的處置，就引起了炎癥。
(3)新生兒皮脂腺分泌亢進，感染形成肛周皮下膿腫與肛竇相通，而致肛瘺。
(4)新生兒生理性免疫機能不全，易發(fā)生肛門感染，形成肛瘺。