發(fā)病原因尚未完全清楚，下列各因素與發(fā)病有關(guān)。
1、解剖因素
小兒骶尾骨彎度小，直腸較垂直，腹內(nèi)壓增高時(shí)，直腸缺乏支持而易于脫垂。直腸前陷凹腹膜反折過(guò)低，腹內(nèi)壓增高和腸袢壓迫使直腸前壁突入直腸壺腹導(dǎo)致脫垂。老年人肌肉松弛，生育過(guò)多或分娩時(shí)會(huì)陰撕裂亦可使直腸發(fā)生脫垂。
2、腹內(nèi)壓增高
長(zhǎng)期便秘、腹瀉、慢性咳嗽和排尿困難等引起腹內(nèi)壓增高，可導(dǎo)致直腸脫垂。近年來(lái)國(guó)外研究發(fā)現(xiàn)，直腸脫垂常伴有精神或神經(jīng)系統(tǒng)疾患，兩者間的關(guān)系目前尚不清楚，有人認(rèn)為神經(jīng)系統(tǒng)病變時(shí)，控制及調(diào)節(jié)排便的功能發(fā)生障礙，直腸慢性擴(kuò)張，對(duì)糞便刺激的敏感性減弱，從而產(chǎn)生便秘和控制排便能力下降。排便時(shí)異常用力，使肛提肌及盆底組織功能減弱，也是直腸脫垂的常見(jiàn)原因。
3、全身因素
營(yíng)養(yǎng)不良小兒，坐骨直腸窩內(nèi)脂肪消失，使直腸失去周?chē)С止潭ㄗ饔?，括約肌群收縮力也減弱，直腸容易自肛門(mén)口脫出。
4、局部組織解剖因素
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嬰幼兒骶骨彎曲度未形成骨盆向前傾斜不夠，直腸呈垂直位，與肛管處于一條直線(xiàn)上，腹腔內(nèi)向下的壓力增加時(shí)，直腸無(wú)骶骨的支持，壓力直接作用到肛管上，易于向下滑動(dòng)。
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肛提肌和骨盆底部肌肉的支持力較弱。
③黏膜松弛
直腸黏膜附著在肌層上較松弛，黏膜易自肌層滑脫。
5、促成因素
任何情況使腹內(nèi)壓長(zhǎng)期增高或突然增高，均可促成直腸脫垂。如經(jīng)常便秘、腹瀉、百日咳、包莖及膀胱結(jié)石、長(zhǎng)期慢性咳嗽等疾患，常是脫肛的誘因。有些疾病(如腰骶部脊髓脊膜膨出)或損傷(包括意外和手術(shù)損傷)造成括約肌及直腸周?chē)∪夤δ芑蛏窠?jīng)功能障礙者，直腸失去支持，腹壓增高即可發(fā)生直腸脫垂。
6、其他
外傷、手術(shù)引起腰骶神經(jīng)麻痹，致肛管括約肌松弛，引起直腸黏膜脫垂。
直腸粘膜脫垂的病因主要是和胃竇部炎癥有關(guān)系的，胃粘膜惡性細(xì)胞浸潤(rùn)也可發(fā)生本病。當(dāng)胃竇部炎癥時(shí)，粘膜下結(jié)締組織較松，胃粘膜和粘膜下層增生，如胃竇蠕動(dòng)增強(qiáng)，則粘膜皺襞很易被送入幽門(mén)，形成胃粘膜脫垂。一切能引起胃劇烈蠕動(dòng)的因素，如精神緊張、煙酒、咖啡刺激等均為直腸粘膜脫垂的病因。
其一：滑動(dòng)性疝學(xué)說(shuō)
認(rèn)為病人的直腸與子宮(男性為膀胱)之間所形成的凹陷過(guò)深，當(dāng)腹內(nèi)的壓力增加時(shí)，直腸前壁承受不了這種壓力，就會(huì)向直腸壺腹部?jī)?nèi)陷，長(zhǎng)期如此，直腸就會(huì)向肛門(mén)外脫出，形成一個(gè)起始于直腸子宮(或膀胱)的凹陷，脫出在肛門(mén)外的直腸由直腸前壁構(gòu)成疝囊，這種脫出主要是直腸前壁，能形成嚴(yán)重的直腸脫垂。
其二：腸套疊學(xué)說(shuō)
認(rèn)為直腸脫垂是因?yàn)橹蹦c與乙狀結(jié)腸之間的固定處，由于某種原因受了損傷，在腹內(nèi)壓力持續(xù)增加時(shí)，上部直腸與部分乙狀結(jié)腸就會(huì)從這個(gè)固定處向下部直腸壺腹套疊，直到脫出肛門(mén)外，形成直腸前壁和后壁長(zhǎng)度相等，腸腔位于中央的直腸脫垂。