由于目前沒有特效的抗病毒藥物，尖銳濕疣的治療必須采用綜合治療。主要包括治療誘因：(白帶過多，包皮過長、淋病)。提高機體免疫力。應(yīng)用抗病藥物。一般只要堅持規(guī)則的綜合治療可以達(dá)到臨床痊愈，但復(fù)發(fā)幾率95%以上。
1、手術(shù)療法 對于單發(fā)、面積小的濕疣，可手術(shù)切除;對巨大尖銳濕疣，可用Mohs氏手術(shù)切除，手術(shù)時用冷凍切片檢查損害是否切除干凈，單一手術(shù)復(fù)發(fā)幾率很高。
2、冷凍療法 利用-196℃低溫的液體氮，采用壓凍法治療尖銳濕疣，促進(jìn)疣組織壞死脫落，本法適用于數(shù)量少，面積小的濕疣，可行1-2次治療，間隔時間為一周,這種方法一般可以清除疣體，容易復(fù)發(fā)。
3、激光治療 通常用CO2激光，采用燒灼法治療尖銳濕疣，本療法最適用女陰、陰莖或肛周的濕疣。對單發(fā)或少量多發(fā)濕疣可行一次性治療，對多發(fā)或面積大的濕疣可2-3次治療，一般在復(fù)發(fā)周期20天-3個月。
4、電灼治療 采用高頻電針或電刀切除濕疣。方法：局部麻醉，然后電灼，本療法適應(yīng)數(shù)量少，面積小的濕疣，這種方法只是清除疣體。
5、微波治療 采用微波手術(shù)治療機，利多卡因局麻，將桿狀輻射探頭尖端插入尖銳濕直達(dá)疣體基底，當(dāng)看到疣體變小、顏色變暗、由軟變硬時，則熱輻射凝固完成，即可抽出探頭。凝固的病灶可以用鑷子挾除。為防止復(fù)發(fā)，可對殘存的基底部重復(fù)凝固一次。
6、β-射線治療 我們應(yīng)用β-射線治療尖銳濕疣取得了較為滿意的效果，該方法療效高，無痛苦、無損傷、副作用少，復(fù)發(fā)率在85%以上，在臨床上有一定推廣價值。
7、藥物療法 常用足葉草酯(尤脫欣、鬼臼毒素、疣迪)、抗病毒藥、腐蝕劑或消毒劑、抗癌藥。
8.免疫療法 自體活菌疫苗免疫療法，干擾素誘導(dǎo)劑，干擾素、白介Ⅱ，卡介素、靈桿菌素等