根據(jù)灰指甲的發(fā)病機(jī)制，可以將其分為原發(fā)性甲真菌病和繼發(fā)性甲真菌病。原發(fā)性甲真菌病是真菌侵犯正常甲板，進(jìn)一步感染形成灰指甲，而繼發(fā)性灰指甲則是指在原有的甲病基礎(chǔ)之上繼發(fā)感染，引起其他的疾病。
通常皮膚癬菌的甲感染屬于原發(fā)性甲真菌病，但有時(shí)候也可見于甲分離癥之后，其它真菌如土曲霉、支頂孢霉、鐮刀霉、頭孢子霉、鏈格孢霉等均為繼發(fā)感染的致病菌，在甲的原發(fā)病痊愈時(shí)，甲真菌病亦可痊愈。但是有一些真菌既可以引起原發(fā)感染，又可以引起繼發(fā)感染，如短帚霉、Brumptii帚霉、柱頂孢霉。
關(guān)于白色念珠菌的致病性，有外國研究者認(rèn)為，念珠菌侵犯甲板與某些甲板的分離有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證實(shí)這一點(diǎn)，白色念珠菌可以入侵甲板，其它念珠菌種尚無可裂解角蛋白的報(bào)道。白色念珠菌甲感染經(jīng)單純口服抗真菌藥物可以治愈，提示可能部分甲營養(yǎng)不良的病例是由念珠菌感染引起的。念珠菌不但可以引起慢性粘膜皮膚念珠菌病或甲溝炎，而且還是原發(fā)性甲床分離癥的重要致病菌，特別在有外周血管疾病或柯興綜合征是更為突出。