在嬰兒，應注意與下列情況鑒別：
1.未成熟兒：頭顱增大較快，有些類似腦積水，但腦室不大。
2.佝僂病：頭顱增大多為方形并有其他佝僂病癥狀。
3.畸形大頭：頭顱大，增長也快，有明顯的智力不足，無眼珠下垂現(xiàn)象，腦室造影正常。
4.慢性硬腦膜下血腫，頭顱增大較慢，硬腦膜下穿可見較多的紅色或黃色液體，眼底有出血，CT可確診。
5.顱內(nèi)占位性病變?nèi)缒[瘤，膿腫等。
在老年人,腦積水還需與因腦萎縮導致的相對腦室系統(tǒng)擴大相鑒別。兩者可以從癥狀，影像學檢查等方面進行鑒別。單純的腦萎縮，沒有腦積水的典型癥狀，如癡呆、小便失禁及步態(tài)不穩(wěn)。CT及MRI上看，腦萎縮者腦室系統(tǒng)擴大，腦溝增寬，關(guān)鍵是沒有腦室周圍水腫表現(xiàn)。