基底核具有復雜的纖維聯(lián)系，主要構成三個重要的神經(jīng)環(huán)路
?、倨べ|(zhì)-皮質(zhì)環(huán)路
大腦皮質(zhì)-尾殼核-內(nèi)側蒼白球-丘腦-大腦皮質(zhì);
?、诤谫|(zhì)-紋狀體環(huán)路
黑質(zhì)與尾狀核、殼核間往返聯(lián)系纖維;
?、奂y狀體-蒼白球環(huán)路
尾狀核、殼核-外側蒼白球-丘腦底核-內(nèi)側蒼白球健康搜索在皮質(zhì)-皮質(zhì)環(huán)路中有直接通路(紋狀體-內(nèi)側蒼白球/黑質(zhì)網(wǎng)狀部)和間接通路(紋狀體-外側蒼白球-丘腦底核-內(nèi)側蒼白球/黑質(zhì)網(wǎng)狀部)環(huán)路是基底核實現(xiàn)運動調(diào)節(jié)功能的解剖學基礎，這兩條通路的活動平衡對實現(xiàn)正常運動功能至關重要。
黑質(zhì)-紋狀體DA通路變性導致基底核輸出過多，丘腦-皮質(zhì)反饋活動受到過度抑制使皮質(zhì)運動功能易化作用受到削弱，產(chǎn)生少動性疾病如帕金森病紋狀體神經(jīng)元變性導致基底核輸出減少丘腦-皮質(zhì)反饋對皮質(zhì)運動功能易化作用過強，產(chǎn)生多動性疾病如亨廷頓病。
因此，基底核遞質(zhì)生化異常和環(huán)路活動紊亂是產(chǎn)生各種運動障礙癥狀的主要病理基礎。運動障礙性疾病治療無論藥物或外科治療原理都基于對遞質(zhì)異常和環(huán)路活動紊亂的糾正。