本身對(duì)放射線抵抗，因此放療僅應(yīng)用于減少盆腔等部位復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移所致的疼痛或不適癥狀。截至目前，多種化療約物被試用于殘留復(fù)發(fā)的以及轉(zhuǎn)移的胃腸間質(zhì)瘤，但客觀有效率均＜7%，未發(fā)現(xiàn)單藥有效率超過(guò)10%的化療藥物，所以不主張對(duì)其進(jìn)行化療。
伊馬替尼（格列衛(wèi)）對(duì)于不能切除的、轉(zhuǎn)移的或復(fù)發(fā)的胃腸間質(zhì)瘤作為一線藥物，在延緩病情發(fā)展、延長(zhǎng)生存期方面效果明顯。伊馬替尼是第一個(gè)用于臨床的酪氨酸激酶抑制劑（TKT），也是第一個(gè)用于臨床治療惡性腫瘤的細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)抑制劑，它的主要作用是能抑制細(xì)胞增殖而誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。
臨床研究結(jié)果表明，對(duì)于不能切除的胃腸道間質(zhì)瘤患者，伊馬替尼能顯著延長(zhǎng)甚至疾病進(jìn)展時(shí)間和總生存時(shí)間。國(guó)內(nèi)外經(jīng)驗(yàn)報(bào)道，伊馬替尼治療后總獲益率可高達(dá)84%，65%～70%患者可達(dá)部分緩解，15%～20%患者疾病穩(wěn)定，5%以下可達(dá)晚期緩解，中位總生存時(shí)間為4.5～5年。伊馬替尼治療反應(yīng)的中位時(shí)間為12一一15周，不應(yīng)在早期未觀察到效果即放棄用藥；不應(yīng)在治療獲益的情況下中斷治療；進(jìn)展期患者應(yīng)連續(xù)服用，無(wú)時(shí)限限制。
對(duì)于腫瘤被完全切除的患者，研究證明同樣存在復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)，所以需要根據(jù)腫瘤的情況確認(rèn)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的分級(jí)，再根據(jù)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的分級(jí)予以相應(yīng)時(shí)間長(zhǎng)度的治療，目的是降低患者手術(shù)后的復(fù)發(fā)，從而延長(zhǎng)患者的生存時(shí)間。
